Dans les bassins versants constituant Artois Picardie, les nitrates sont plutôt en hausse, surtout après 1998. Ce bassin est marqué par une forte présence de l'agriculture. Les autres paramètres, excepté l'oxygène dissous qui est stable, sont en baisse grâce à l'amélioration des traitements réalisés par les stations d'épuration. Les concentrations relevées en 2007 sont néanmoins supérieures à la moyenne nationale.
Concernant le bassin Rhin Meuse, proche de la moyenne nationale dans sa répartition entre agriculture et milieux semi naturels et forestiers, les nitrates sont globalement en baisse malgré une hausse amorcée après 2003. L'oxygène dissous est stable. Quant aux autres paramètres, la diminution est marquée mais ralentit après 2002. Seuls les nitrates et nitrites présentent des concentrations inférieures aux moyennes nationales en 2007.
La Seine Normandie présente une occupation des sols très contrastée, tout en étant assez agricole. Les concentrations en nitrates sont relativement importantes (en augmentation) et supérieures à la moyenne nationale en 2007 tandis que les paramètres liés aux rejets urbains diminuent grâce à l'amélioration des traitements épuratoires, notamment sur la station d'épuration d'Achères.
La Loire Bretagne, grand bassin tourné vers l'agriculture, fait figure d'exception avec une diminution des nitrates. Malgré tout, les concentrations restent élevées. Quant aux paramètres liés aux rejets urbains, ils sont également en baisse comme au niveau national, en relation avec la rénovation des stations d'épuration.
En Adour Garonne , grand bassin peu marqué par l'agriculture et l'urbanisation, les nitrates sont plutôt en hausse ces trente dernières années. Les concentrations en 2007 restent néanmoins inférieures à la moyenne nationale, sauf en Poitou-Charentes. La diminution des orthophosphates et de la DBO 5 y est moins sensible qu'à l'échelle nationale, notamment sur le littoral aquitain.
Enfin, dans le bassin Rhône-Méditerranée-Corse, où l'occupation des sols est très contrastée mais en moyenne peu agricole, les nitrates sont en hausse, surtout après 2003. L'oxygène dissous reste stable, les autres paramètres sont en baisse, comme à l'échelle nationale.