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Plusieurs types de mesures sont programmés dans le cadre de cette campagne qui couvrira le pourtour de la Méditerranée occidentale : région Languedoc-Roussillon, région PACA, Corse et Monaco. Parmi elles, la mise en oeuvre de 75 stations artificielles de moules permettra de déterminer la contamination chimique de l'eau.
Les moules font en effet partie des bio-indicateurs, ces organismes qui révèlent par leur présence, leur absence ou leur comportement démographiques, les caractéristiques et l'évolution d'un milieu. Les invertébrés et les diatomées en sont des exemples en eaux douces : une analyse précise des populations et des espèces de diatomées présentes peut mettre en évidence des modifications de pH voire de salinité tandis qu'une grande richesse en invertébrés de taille moyenne comprise entre 5 mm et 20 mm caractérise une rivière peu impactée.
Dans le cas des moules c'est leur besoin de filtrer l'eau qui intéresse les scientifiques. En filtrant l'eau de mer, ces organismes concentrent différentes substances présentes dans l'environnement marin (métaux, hydrocarbures, solvants). Après un séjour de plusieurs mois dans l'eau, les niveaux mesurés dans les organismes sont le résultat et le reflet de l'état chronique du milieu.
Au cours de cette campagne, les équipes de recherche effectueront également une collecte d'échantillons de sédiment pour évaluer les niveaux de contamination chimique, leur potentiel écotoxicologique et étudier la biologie des espèces vivant sur les fonds sableux et vaseux. Les chercheurs s'intéresseront plus spécifiquement aux foraminifères benthiques, ces micro-organismes marins vivant sur le fond, en raison de leur capacité de réponse forte et rapide aux variations des paramètres environnementaux. Leur abondance et leur diversité détermineront par conséquent la qualité du milieu.
Des prélèvements d'eau vont servir à évaluer les niveaux en sels nutritifs et en chlorophylle, et à suivre la composition et l'abondance du phytoplancton.
Des observations vont également permettre d'évaluer l'état de santé des herbiers de Posidonie. Cette plante constitue un maillon essentiel de la vie marine en servant d'abri, de lieu de reproduction et de source de nourriture à un grand nombre d'espèces en Méditerranée et représente un très bon indicateur biologique de la qualité des eaux.
L'ensemble des mesures sera comparé à celles obtenues lors de la première campagne de 2006. Elles permettront d'évaluer l'évolution de la qualité du milieu et d'en déduire son niveau par rapport aux exigences de la directive européenne.