De 1995 à 1999, elle occupe les fonctions de Directeur Adjoint puis de Directeur Délégué à la Direction du Personnel et des Relations Sociales d'EDF-GDF. À ce titre, elle accompagne les premières grandes négociations sociales (emploi, temps de travail, formation, salaires, intégration des handicapés,...).
Début 1999, Michèle Bellon est Directeur Adjoint à la Direction Générale d'EDF-Pôle Clients où elle participe au lancement de l'ouverture des marchés et au développement d'EDF à l'international (EDF Energy, EnBW et EDF-Trading). Mi 2000, elle est nommée Directeur de la Division combustibles nucléaires.
En 2001, Michèle Bellon rejoint le groupe Dalkia, filiale commune d'EDF et de Veolia, en tant que Directeur Général Adjoint de Dalkia et Directeur Général de Dalkia International. Elle assure notamment le pilotage des négociations avec les grands groupes industriels et la relation avec de nombreux élus territoriaux.
Michèle Bellon est Chevalier de l'Ordre National du Mérite et administrateur de l'Institut Pasteur de Shanghaï.