En 2006, le thème retenu a été « les zones humides, instrument de l'allégement de la pauvreté ». Il a été décliné au niveau national sur la base du slogan « les zones humides, supports d'un développement local durable ». À cette occasion, de nombreux acteurs (parcs naturels, établissements publics, ONG, associations, etc) ont mis en place de nouveaux outils de préservation et ont organisé des opérations de nettoyage, des visites, des courses d'orientation ou encore des conférences. Cette année, près de 200 manifestations ont été menées à l'échelle du territoire national.
La convention de Ramsar est le seul traité sur l'environnement de portée mondiale qui soit consacré à un écosystème particulier. Elle a pour mission « la conservation et l'utilisation rationnelle des zones humides par des actions locales, régionales et nationales et par la coopération internationale, en tant que contribution à la réalisation du développement durable dans le monde entier ». Entrée en vigueur en 1975 et ratifiée par la France en 1986, elle compte, au 1er janvier 2006, 146 Parties contractantes pour 1459 zones humides soit plus de 125 millions d'hectares.
La 9ème conférence des parties de la convention de Ramsar s'est tenue en novembre 2005, à Kampala en Ouganda. Elle s'est conclue par l'adoption de 25 résolutions et d'un programme de travail pour 2006-2008. Les participants ont réaffirmé leur volonté d'ouverture de la convention à des thématiques plus larges que sa préoccupation initiale de conservation des habitats d'oiseaux d'eau. Ils ont rappelé également l'importance de la formation, des échanges de savoir faire et de l'évaluation des projets pour la préservation et la gestion durable des milieux humides. Le programme de travail prévoit également la participation des signataires aux travaux d'autres grandes conventions notamment la Convention sur la Diversité Biologique. La conférence des parties contractantes se réunit tous les trois ans. La prochaine session aura lieu en novembre 2008 en Corée du Sud.
La France compte désormais 23 sites bénéficiant de la protection internationale Ramsar, couvrant 928.109 hectares. Officiellement inscrit à l'occasion de cette journée, le site des Étangs de la Narbonnaise est le dernier en date à rejoindre les sites protégés. Situé en Languedoc-Roussillon, il réunit un ensemble de cinq lagunes méditerranéennes : Bages-Sigean, Ayrolle, Campignol, Gruissan et La Palme. Elles sont en communication avec la mer par quatre graus et alimentées en eau douce par un ensemble de neuf sous-bassins versants. Les graus de l'Ayrolle et de La Palme n'ont pas été endigués, et sont les derniers à fonctionner de façon naturelle sur le littoral méditerranéen français. Caractérisé par des milieux différents (herbiers, étendues sableuses, dunes, îles), ce site a été peu urbanisé et constitue de ce fait une richesse paysagère remarquable à l'échelle régionale.
Un autre dossier est à ce jour à l'étude, celui des mares temporaires de Tre Padule en Corse et devrait aboutir en 2006.
Cette journée mondiale des zones humides est l'occasion de rappeler l'utilité de ces milieux : lutte contre les inondations, gestion et préservation et de la ressource en eau, maintien de la biodiversité, activités touristiques et culturelles, etc. Malheureusement les dernières décennies ont été marquées par la régression des zones humides dans le monde entier et la France n'échappe pas à cette tendance. Les zones humides nationales couvrent environ 1,5 millions d'hectares, soit un peu plus de 2.5% du territoire national, selon la dernière évaluation nationale de 2001. On estime que deux tiers des zones humides ont disparu en France entre la fin du 19ème siècle et les années 1990. Cette tendance est toujours vraie dans certains types précis d'habitats comme les tourbières, ou les landes.